微害档案的微生物主要是霉菌，常见的有以下几种。

（1、）曲霉，曲霉具有分解纤维素、本质素、淀粉及油墨等物质的能力，对纸质档案危害较大。

（2、）青霉，青霉能够危害纸质档案，使纸张酸度增加，有资料报导，被草醇青霉危害几个月后的纸张可以分离出浓度为5%的一定量的草酸，促使纸张发生水解反应，使纸张变黄、发脆。另外，青霉能将某些字迹材料中的油脂水解，使字迹脱落。

（3、）根霉，根霉能酶解淀粉，本质素、粘胶剂等。黑根霉，不仅具有这些破坏能力还能在其生理活动中产生有机酸，促进纸张纤维素的水解。

（4、）毛霉，毛霉喜食各种淀粉物质和胶粘剂，也具有分解蛋白质的能力。因此，对纸质档案的封面、装裱材料以及胶片的危害较大。此外，毛霉在生长发育过程中，能够产生某些霉素危害人体健康，使人患肺毛霉菌疾、脑膜炎及视力下降或失明等疾病。

（5、）木霉，木霉能分泌纤维素酶，分解纸张及本制装具中的纤维素和本质素，加速对纸质档案及本制装具的破坏。
总之，微生物对档案的危害很大，它们既危害纸质档案，也危害新型载体档案，如照片、胶片等。